Protein–RNA interactions for Protein: E9PW74

Gimd1, GTPase IMAP family member GIMD1, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gimd1E9PW74 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gimd1E9PW74 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms