Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3002E9PW72 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms