Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms