Protein–RNA interactions for Protein: E9PV82

Fam53a, Protein FAM53A, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam53aE9PV82 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam53aE9PV82 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms