Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms