Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms