Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms