Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms