Protein–RNA interactions for Protein: D3YV11

Gm5475, Predicted gene 5475, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5475D3YV11 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5475D3YV11 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5475D3YV11 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5475D3YV11 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5475D3YV11 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5475D3YV11 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5475D3YV11 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5475D3YV11 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5475D3YV11 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5475D3YV11 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5475D3YV11 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5475D3YV11 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5475D3YV11 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5475D3YV11 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms