Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc13D3YV10 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms