Protein–RNA interactions for Protein: C0LLJ0

Kpna7, Importin subunit alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna7C0LLJ0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kpna7C0LLJ0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kpna7C0LLJ0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kpna7C0LLJ0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kpna7C0LLJ0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kpna7C0LLJ0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kpna7C0LLJ0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kpna7C0LLJ0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kpna7C0LLJ0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kpna7C0LLJ0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kpna7C0LLJ0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kpna7C0LLJ0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kpna7C0LLJ0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kpna7C0LLJ0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kpna7C0LLJ0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kpna7C0LLJ0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms