Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms