Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20547B8JJN0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20547B8JJN0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20547B8JJN0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20547B8JJN0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20547B8JJN0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20547B8JJN0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20547B8JJN0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20547B8JJN0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20547B8JJN0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20547B8JJN0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20547B8JJN0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20547B8JJN0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20547B8JJN0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20547B8JJN0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20547B8JJN0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20547B8JJN0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20547B8JJN0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20547B8JJN0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20547B8JJN0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20547B8JJN0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20547B8JJN0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20547B8JJN0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20547B8JJN0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20547B8JJN0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20547B8JJN0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20547B8JJN0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20547B8JJN0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms