Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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