Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC6

Polr3a, DNA-directed RNA polymerase subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3aB2RXC6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Polr3aB2RXC6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Polr3aB2RXC6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Polr3aB2RXC6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Polr3aB2RXC6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Polr3aB2RXC6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Polr3aB2RXC6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Polr3aB2RXC6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Polr3aB2RXC6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Polr3aB2RXC6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr3aB2RXC6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr3aB2RXC6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr3aB2RXC6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr3aB2RXC6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr3aB2RXC6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr3aB2RXC6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr3aB2RXC6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr3aB2RXC6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr3aB2RXC6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr3aB2RXC6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr3aB2RXC6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr3aB2RXC6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr3aB2RXC6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr3aB2RXC6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr3aB2RXC6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr3aB2RXC6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr3aB2RXC6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr3aB2RXC6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr3aB2RXC6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr3aB2RXC6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr3aB2RXC6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr3aB2RXC6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr3aB2RXC6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr3aB2RXC6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Polr3aB2RXC6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Polr3aB2RXC6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Polr3aB2RXC6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms