Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cfap58B2RW38 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cfap58B2RW38 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cfap58B2RW38 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cfap58B2RW38 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cfap58B2RW38 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cfap58B2RW38 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cfap58B2RW38 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cfap58B2RW38 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cfap58B2RW38 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cfap58B2RW38 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cfap58B2RW38 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cfap58B2RW38 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cfap58B2RW38 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cfap58B2RW38 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cfap58B2RW38 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cfap58B2RW38 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cfap58B2RW38 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cfap58B2RW38 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cfap58B2RW38 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cfap58B2RW38 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cfap58B2RW38 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cfap58B2RW38 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cfap58B2RW38 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cfap58B2RW38 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cfap58B2RW38 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cfap58B2RW38 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cfap58B2RW38 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Cfap58B2RW38 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cfap58B2RW38 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cfap58B2RW38 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cfap58B2RW38 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cfap58B2RW38 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cfap58B2RW38 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cfap58B2RW38 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cfap58B2RW38 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cfap58B2RW38 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cfap58B2RW38 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cfap58B2RW38 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cfap58B2RW38 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cfap58B2RW38 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cfap58B2RW38 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cfap58B2RW38 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cfap58B2RW38 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cfap58B2RW38 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms