Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms