Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms