Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Brpf3B2KF05 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Brpf3B2KF05 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Brpf3B2KF05 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Brpf3B2KF05 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Brpf3B2KF05 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brpf3B2KF05 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brpf3B2KF05 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms