Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H60cB1B213 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
H60cB1B213 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H60cB1B213 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H60cB1B213 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H60cB1B213 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H60cB1B213 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
H60cB1B213 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H60cB1B213 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H60cB1B213 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H60cB1B213 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H60cB1B213 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H60cB1B213 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H60cB1B213 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H60cB1B213 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms