Protein–RNA interactions for Protein: B1AVZ0

Uprt, Uracil phosphoribosyltransferase homolog, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UprtB1AVZ0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UprtB1AVZ0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
UprtB1AVZ0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UprtB1AVZ0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UprtB1AVZ0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UprtB1AVZ0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UprtB1AVZ0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UprtB1AVZ0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UprtB1AVZ0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UprtB1AVZ0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UprtB1AVZ0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UprtB1AVZ0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UprtB1AVZ0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UprtB1AVZ0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UprtB1AVZ0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UprtB1AVZ0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UprtB1AVZ0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UprtB1AVZ0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UprtB1AVZ0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UprtB1AVZ0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UprtB1AVZ0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UprtB1AVZ0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UprtB1AVZ0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UprtB1AVZ0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UprtB1AVZ0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UprtB1AVZ0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UprtB1AVZ0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UprtB1AVZ0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UprtB1AVZ0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms