Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms