Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhl41A2AUC9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhl41A2AUC9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhl41A2AUC9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhl41A2AUC9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhl41A2AUC9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klhl41A2AUC9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klhl41A2AUC9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klhl41A2AUC9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klhl41A2AUC9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klhl41A2AUC9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klhl41A2AUC9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klhl41A2AUC9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klhl41A2AUC9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klhl41A2AUC9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klhl41A2AUC9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klhl41A2AUC9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klhl41A2AUC9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klhl41A2AUC9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhl41A2AUC9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhl41A2AUC9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhl41A2AUC9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhl41A2AUC9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhl41A2AUC9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhl41A2AUC9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhl41A2AUC9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhl41A2AUC9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhl41A2AUC9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhl41A2AUC9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhl41A2AUC9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhl41A2AUC9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhl41A2AUC9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhl41A2AUC9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhl41A2AUC9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhl41A2AUC9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klhl41A2AUC9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klhl41A2AUC9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klhl41A2AUC9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klhl41A2AUC9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klhl41A2AUC9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klhl41A2AUC9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klhl41A2AUC9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klhl41A2AUC9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klhl41A2AUC9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Klhl41A2AUC9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klhl41A2AUC9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klhl41A2AUC9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klhl41A2AUC9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klhl41A2AUC9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klhl41A2AUC9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Klhl41A2AUC9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Klhl41A2AUC9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Klhl41A2AUC9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klhl41A2AUC9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klhl41A2AUC9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Klhl41A2AUC9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klhl41A2AUC9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klhl41A2AUC9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klhl41A2AUC9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klhl41A2AUC9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klhl41A2AUC9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klhl41A2AUC9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klhl41A2AUC9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klhl41A2AUC9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klhl41A2AUC9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klhl41A2AUC9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klhl41A2AUC9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klhl41A2AUC9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klhl41A2AUC9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klhl41A2AUC9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klhl41A2AUC9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klhl41A2AUC9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klhl41A2AUC9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Klhl41A2AUC9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klhl41A2AUC9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klhl41A2AUC9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klhl41A2AUC9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klhl41A2AUC9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klhl41A2AUC9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klhl41A2AUC9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klhl41A2AUC9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klhl41A2AUC9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klhl41A2AUC9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klhl41A2AUC9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klhl41A2AUC9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klhl41A2AUC9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klhl41A2AUC9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klhl41A2AUC9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klhl41A2AUC9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klhl41A2AUC9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klhl41A2AUC9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klhl41A2AUC9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klhl41A2AUC9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klhl41A2AUC9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klhl41A2AUC9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Klhl41A2AUC9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klhl41A2AUC9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klhl41A2AUC9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klhl41A2AUC9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klhl41A2AUC9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms