Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI9

Pramef25, PRAME family member 25, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef25A2ASI9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms