Protein–RNA interactions for Protein: A2ARA8

Itga8, Integrin alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga8A2ARA8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga8A2ARA8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga8A2ARA8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga8A2ARA8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga8A2ARA8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga8A2ARA8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga8A2ARA8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga8A2ARA8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms