Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms