Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms