Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms