Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prdm16A2A935 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms