Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms