Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cdc27A2A6Q5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms