Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2l1A2A259 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2l1A2A259 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2l1A2A259 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2l1A2A259 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2l1A2A259 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2l1A2A259 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2l1A2A259 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2l1A2A259 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2l1A2A259 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2l1A2A259 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2l1A2A259 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2l1A2A259 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2l1A2A259 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2l1A2A259 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2l1A2A259 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2l1A2A259 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2l1A2A259 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2l1A2A259 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2l1A2A259 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2l1A2A259 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2l1A2A259 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2l1A2A259 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2l1A2A259 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2l1A2A259 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2l1A2A259 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2l1A2A259 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2l1A2A259 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2l1A2A259 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2l1A2A259 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2l1A2A259 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2l1A2A259 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2l1A2A259 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2l1A2A259 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2l1A2A259 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2l1A2A259 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2l1A2A259 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2l1A2A259 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2l1A2A259 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2l1A2A259 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pkd2l1A2A259 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pkd2l1A2A259 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pkd2l1A2A259 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pkd2l1A2A259 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pkd2l1A2A259 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pkd2l1A2A259 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms