Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms