Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms