Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
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