Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YTR2

0610012G03Rik, RIKEN cDNA 0610012G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
0610012G03RikA0A0J9YTR2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms