Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Trbv30A0A0B4J1P1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Trbv30A0A0B4J1P1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Trbv30A0A0B4J1P1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Trbv30A0A0B4J1P1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Trbv30A0A0B4J1P1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Trbv30A0A0B4J1P1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Trbv30A0A0B4J1P1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Trbv30A0A0B4J1P1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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