Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1K3

B230359F08Rik, RIKEN cDNA B230359F08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230359F08RikA0A0B4J1K3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms