Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H4

Trbv19, T cell receptor beta, variable 19 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv19A0A0B4J1H4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Trbv19A0A0B4J1H4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trbv19A0A0B4J1H4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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