Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H0

Trbv12-1, T cell receptor beta, variable 12-1 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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