Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQW2

Gm28363, Predicted gene 28363 (Fragment), mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28363A0A087WQW2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28363A0A087WQW2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28363A0A087WQW2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28363A0A087WQW2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28363A0A087WQW2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28363A0A087WQW2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28363A0A087WQW2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm28363A0A087WQW2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28363A0A087WQW2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28363A0A087WQW2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28363A0A087WQW2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28363A0A087WQW2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28363A0A087WQW2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28363A0A087WQW2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm28363A0A087WQW2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28363A0A087WQW2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm28363A0A087WQW2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28363A0A087WQW2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28363A0A087WQW2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm28363A0A087WQW2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28363A0A087WQW2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28363A0A087WQW2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28363A0A087WQW2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm28363A0A087WQW2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm28363A0A087WQW2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28363A0A087WQW2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28363A0A087WQW2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28363A0A087WQW2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm28363A0A087WQW2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28363A0A087WQW2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm28363A0A087WQW2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm28363A0A087WQW2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28363A0A087WQW2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gm28363A0A087WQW2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm28363A0A087WQW2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Gm28363A0A087WQW2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm28363A0A087WQW2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm28363A0A087WQW2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28363A0A087WQW2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28363A0A087WQW2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28363A0A087WQW2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28363A0A087WQW2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28363A0A087WQW2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28363A0A087WQW2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28363A0A087WQW2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28363A0A087WQW2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28363A0A087WQW2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28363A0A087WQW2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28363A0A087WQW2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28363A0A087WQW2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28363A0A087WQW2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28363A0A087WQW2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28363A0A087WQW2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28363A0A087WQW2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28363A0A087WQW2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28363A0A087WQW2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28363A0A087WQW2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28363A0A087WQW2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm28363A0A087WQW2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms