Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Gm29308-201ENSMUST00000188863 315 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Gm28537-201ENSMUST00000189026 315 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Gm29631-201ENSMUST00000191065 315 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Trav5-2-201ENSMUST00000199855 280 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Gm44962-201ENSMUST00000206460 279 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Mir221-201ENSMUST00000083488 95 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Gm25627-201ENSMUST00000084003 153 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Gm6377-201ENSMUST00000060013 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Gm23718-201ENSMUST00000157350 307 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 U6.1-201ENSMUST00000157443 101 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Gm23558-201ENSMUST00000157823 80 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Gm17020-201ENSMUST00000172274 274 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Gm26097-201ENSMUST00000179642 93 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Gm18213-201ENSMUST00000207850 178 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 AC151902.2-201ENSMUST00000226419 301 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Gm25697-201ENSMUST00000082902 98 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Gm21940-201ENSMUST00000204940 2278 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Zfp616-205ENSMUST00000178159 2964 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 AC164629.4-201ENSMUST00000218505 3247 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Gm23898-201ENSMUST00000158111 103 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Gm24054-201ENSMUST00000158619 105 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Gm25716-201ENSMUST00000158628 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Gm26004-201ENSMUST00000158804 116 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Gm27511-201ENSMUST00000183502 127 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Gm42988-201ENSMUST00000198116 225 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Gm45754-201ENSMUST00000212380 279 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 AC154994.1-201ENSMUST00000217395 302 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Gm24038-201ENSMUST00000082872 159 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 AC160984.1-201ENSMUST00000225855 3154 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Gm22148-201ENSMUST00000104445 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Gm22963-201ENSMUST00000157960 91 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Gm24902-201ENSMUST00000158126 123 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Gm23208-201ENSMUST00000158666 127 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Gm24366-201ENSMUST00000175383 86 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Rnu6-ps2-201ENSMUST00000178059 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Gm42719-201ENSMUST00000197393 355 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 1700016B01Rik-201ENSMUST00000197688 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 AC164561.1-201ENSMUST00000220414 115 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 AC134601.1-201ENSMUST00000221058 109 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Gm25081-201ENSMUST00000082534 108 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Gm22306-201ENSMUST00000082692 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Gm22686-201ENSMUST00000082847 100 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Gm25136-201ENSMUST00000083253 115 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Mir223-201ENSMUST00000102112 110 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Gm23578-201ENSMUST00000103943 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Gm22545-201ENSMUST00000104350 132 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Gm23772-201ENSMUST00000104433 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Gm14674-201ENSMUST00000117816 342 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Scarna3b-201ENSMUST00000157533 139 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Gm26160-201ENSMUST00000158965 63 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Gm25958-201ENSMUST00000175114 71 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Gm25035-201ENSMUST00000175414 77 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 A730009L09Rik-202ENSMUST00000210306 201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 AC069074.1-201ENSMUST00000220048 381 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Gm6952-201ENSMUST00000118629 159 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Gm11792-201ENSMUST00000120640 168 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Zfp960-201ENSMUST00000127027 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Gm22163-201ENSMUST00000158408 135 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Gm16546-201ENSMUST00000159442 355 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Mir7039-201ENSMUST00000183852 85 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Gm28794-201ENSMUST00000185276 136 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 8030445P17Rik-201ENSMUST00000192614 2741 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Gm44177-201ENSMUST00000204338 2667 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Gm45027-201ENSMUST00000207081 78 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Gm23678-201ENSMUST00000083157 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Mir488-201ENSMUST00000093595 109 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Gm24276-201ENSMUST00000102181 110 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Chsy1Q6ZQ11 Mir1298-201ENSMUST00000116681 98 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Chsy1Q6ZQ11 Gm25558-201ENSMUST00000158083 106 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Chsy1Q6ZQ11 Gm23221-201ENSMUST00000158118 93 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Chsy1Q6ZQ11 Gm25267-201ENSMUST00000158522 63 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Chsy1Q6ZQ11 Gm22139-201ENSMUST00000158747 105 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Chsy1Q6ZQ11 Gm17215-201ENSMUST00000170074 277 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Chsy1Q6ZQ11 Gm22286-201ENSMUST00000179708 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Chsy1Q6ZQ11 Gm14917-201ENSMUST00000118872 2105 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Chsy1Q6ZQ11 Olfr8-203ENSMUST00000214952 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Chsy1Q6ZQ11 Gm26074-201ENSMUST00000104063 129 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Chsy1Q6ZQ11 Gm16404-201ENSMUST00000177739 468 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Chsy1Q6ZQ11 Gm14598-201ENSMUST00000180109 468 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Chsy1Q6ZQ11 Gm14625-201ENSMUST00000180231 468 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Chsy1Q6ZQ11 Gm27517-201ENSMUST00000184347 236 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Chsy1Q6ZQ11 Gm29603-201ENSMUST00000186792 334 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Chsy1Q6ZQ11 AL928567.1-201ENSMUST00000197891 138 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Chsy1Q6ZQ11 Gm44464-201ENSMUST00000198010 138 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Chsy1Q6ZQ11 Gm44384-201ENSMUST00000200208 114 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Chsy1Q6ZQ11 Mir186-201ENSMUST00000083497 71 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Chsy1Q6ZQ11 Gm24261-201ENSMUST00000083744 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Chsy1Q6ZQ11 Mir490-201ENSMUST00000093567 84 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Chsy1Q6ZQ11 Gm10730-201ENSMUST00000194097 2723 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Chsy1Q6ZQ11 AC153950.1-201ENSMUST00000219916 3238 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Chsy1Q6ZQ11 Gm22790-201ENSMUST00000157229 129 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Chsy1Q6ZQ11 Gm23122-201ENSMUST00000157645 103 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Chsy1Q6ZQ11 Gm22551-201ENSMUST00000157795 103 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Chsy1Q6ZQ11 Gm24001-201ENSMUST00000158463 85 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Chsy1Q6ZQ11 Gm17364-201ENSMUST00000163881 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Chsy1Q6ZQ11 AC192091.2-201ENSMUST00000217869 117 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Chsy1Q6ZQ11 CT030645.1-201ENSMUST00000224020 231 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Chsy1Q6ZQ11 AC129085.1-201ENSMUST00000225263 165 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Chsy1Q6ZQ11 Gm25855-201ENSMUST00000082787 72 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Chsy1Q6ZQ11 Traj26-201ENSMUST00000103715 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
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