Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm23838-201ENSMUST00000158067 162 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 Gm20409-201ENSMUST00000173457 130 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 Gm45038-201ENSMUST00000207537 3838 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 AC144783.2-201ENSMUST00000219089 195 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 Gm23246-201ENSMUST00000083371 67 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 Olfr25-203ENSMUST00000214155 6479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 Olfr1270-204ENSMUST00000215975 4854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 Gm23011-201ENSMUST00000104148 132 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 Gm25061-201ENSMUST00000104665 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 Gm25490-201ENSMUST00000158734 130 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 Olfr1421-ps1-201ENSMUST00000208900 208 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 Mir34a-201ENSMUST00000083559 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 Olfr1046-202ENSMUST00000213987 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 Olfr65-203ENSMUST00000214300 2855 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 Uty-208ENSMUST00000154004 4267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 Vmn1r13-204ENSMUST00000227421 5235 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 Zfp985-201ENSMUST00000081742 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 Mir293-201ENSMUST00000104841 80 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 Gm24787-201ENSMUST00000157380 123 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 Gm22858-201ENSMUST00000174972 76 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 Gm9967-203ENSMUST00000206903 408 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 Gm23615-201ENSMUST00000082602 65 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 Zbtb37-203ENSMUST00000162226 18814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 Gm45518-201ENSMUST00000210776 2583 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Gm43373-201ENSMUST00000202552 2870 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Olfr1229-203ENSMUST00000214593 3404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Olfr1211-203ENSMUST00000213412 4173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 n-R5s191-201ENSMUST00000122724 116 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Gm23470-201ENSMUST00000157129 120 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Gm24238-201ENSMUST00000157792 98 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Gm23380-201ENSMUST00000158448 103 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Mir8116-201ENSMUST00000184134 97 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Gm25627-201ENSMUST00000084003 153 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Olfr509-202ENSMUST00000213756 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Ccdc18-201ENSMUST00000047677 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Olfr1369-ps1-205ENSMUST00000215941 3597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Vmn1r79-203ENSMUST00000227530 5581 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Mroh9-201ENSMUST00000096608 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 8030445P17Rik-201ENSMUST00000192614 2741 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Olfr116-202ENSMUST00000216128 4477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Gm23468-201ENSMUST00000157125 108 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Gm25488-201ENSMUST00000158728 118 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Gm24801-201ENSMUST00000178503 105 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Gm27698-201ENSMUST00000184060 249 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Mir7009-201ENSMUST00000184519 64 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Gm28358-202ENSMUST00000189292 223 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Gm37007-201ENSMUST00000194234 319 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Gm44393-201ENSMUST00000197418 138 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Gm25124-201ENSMUST00000083345 164 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Gm25337-201ENSMUST00000083723 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 C87977-201ENSMUST00000105753 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Olfr166-202ENSMUST00000213531 4205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Olfr1256-203ENSMUST00000213833 6081 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Olfr1442-204ENSMUST00000208657 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Gm16171-201ENSMUST00000118004 324 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Gm25370-201ENSMUST00000158159 94 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Rnu7-201ENSMUST00000158458 62 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Gm24637-201ENSMUST00000158674 85 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Trav5d-3-201ENSMUST00000170041 270 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Gm25354-201ENSMUST00000179110 105 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Mir6376-201ENSMUST00000185149 131 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Olfr1354-202ENSMUST00000204587 3781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Vmn1r13-203ENSMUST00000227298 5203 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Gm25539-201ENSMUST00000116886 122 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Gm13862-201ENSMUST00000121220 197 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Gm26277-201ENSMUST00000157097 152 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Gm23351-201ENSMUST00000158427 125 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Gm27379-201ENSMUST00000183730 123 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Gm8739-201ENSMUST00000185962 181 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Trbv25-201ENSMUST00000194700 273 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Gm44491-201ENSMUST00000196794 96 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Gm20108-201ENSMUST00000219977 153 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Gm25628-201ENSMUST00000084002 105 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Gm5141-202ENSMUST00000201047 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Gpr22-201ENSMUST00000057783 4587 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Olfr1245-202ENSMUST00000217402 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 C230088H06Rik-202ENSMUST00000181752 3010 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Gm3081-201ENSMUST00000193413 3025 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Gm26624-201ENSMUST00000181486 3769 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Gm22658-201ENSMUST00000104196 155 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Gm12309-201ENSMUST00000119889 182 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Gm11414-201ENSMUST00000121795 263 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Gm23715-201ENSMUST00000157354 106 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Gm25371-201ENSMUST00000158162 101 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Mir1931-201ENSMUST00000158589 119 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 B230216N24Rik-202ENSMUST00000159353 345 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Gm23917-201ENSMUST00000175256 98 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Gm23090-201ENSMUST00000177331 78 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 4930469B13Rik-202ENSMUST00000224808 348 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Spata45-201ENSMUST00000077889 432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Olfr1193-203ENSMUST00000216767 3690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Zfp40-206ENSMUST00000172177 2736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Gm45178-201ENSMUST00000207744 4110 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Gm44560-201ENSMUST00000207816 3115 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Olfr652-204ENSMUST00000219111 5329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Gm22961-201ENSMUST00000157964 106 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Mir5123-201ENSMUST00000177794 83 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Gm35736-201ENSMUST00000203681 313 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 AC153930.1-201ENSMUST00000220016 358 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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