Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 AC161250.2-201ENSMUST00000215114 3107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Chmp3Q9CQ10 Olfr748-202ENSMUST00000213101 3632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
Chmp3Q9CQ10 Gm24171-201ENSMUST00000104126 131 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Chmp3Q9CQ10 Mir293-201ENSMUST00000104841 80 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Chmp3Q9CQ10 Gm8260-201ENSMUST00000119230 353 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Chmp3Q9CQ10 Gm15281-201ENSMUST00000125181 351 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Chmp3Q9CQ10 Mir3076-201ENSMUST00000175415 60 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Chmp3Q9CQ10 Gm26864-201ENSMUST00000181346 156 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Chmp3Q9CQ10 Gm43324-201ENSMUST00000197482 289 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Chmp3Q9CQ10 Gm45027-201ENSMUST00000207081 78 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
Chmp3Q9CQ10 CT009696.1-201ENSMUST00000215745 256 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Chmp3Q9CQ10 Mir489-201ENSMUST00000093599 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Chmp3Q9CQ10 Olfr1442-204ENSMUST00000208657 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
Chmp3Q9CQ10 Gm25526-201ENSMUST00000104332 132 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Chmp3Q9CQ10 Gm26277-201ENSMUST00000157097 152 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Chmp3Q9CQ10 Gm25558-201ENSMUST00000158083 106 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Chmp3Q9CQ10 Gm25367-201ENSMUST00000158846 106 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Chmp3Q9CQ10 Gm27878-201ENSMUST00000184000 106 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Chmp3Q9CQ10 Gm16976-205ENSMUST00000227324 226 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Chmp3Q9CQ10 Mir29c-201ENSMUST00000083614 88 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Chmp3Q9CQ10 Gm25627-201ENSMUST00000084003 153 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Chmp3Q9CQ10 Gm1980-201ENSMUST00000123131 2306 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Chmp3Q9CQ10 Zfp280c-202ENSMUST00000076635 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp3Q9CQ10 Gm25884-201ENSMUST00000157782 62 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp3Q9CQ10 Gm22651-201ENSMUST00000157872 94 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp3Q9CQ10 Gm25364-201ENSMUST00000158851 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp3Q9CQ10 Gm25476-201ENSMUST00000175125 185 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp3Q9CQ10 Ighv1-1-201ENSMUST00000194912 291 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp3Q9CQ10 Mir7215-201ENSMUST00000200383 51 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp3Q9CQ10 Spata45-201ENSMUST00000077889 432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp3Q9CQ10 Gm26458-201ENSMUST00000082832 128 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp3Q9CQ10 Vmn1r185-204ENSMUST00000227411 4928 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp3Q9CQ10 Olfr1151-202ENSMUST00000217376 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Chmp3Q9CQ10 Gm22004-201ENSMUST00000101884 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Chmp3Q9CQ10 Mir466k-201ENSMUST00000116774 122 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Chmp3Q9CQ10 Gm16111-201ENSMUST00000162128 285 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Chmp3Q9CQ10 AC168056.1-201ENSMUST00000225270 180 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Chmp3Q9CQ10 Acer3-202ENSMUST00000120520 3964 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Chmp3Q9CQ10 Olfr479-202ENSMUST00000209805 2902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Chmp3Q9CQ10 Vmn1r185-208ENSMUST00000228004 5682 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Chmp3Q9CQ10 Olfr509-203ENSMUST00000214861 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Chmp3Q9CQ10 Gm37331-201ENSMUST00000192367 3375 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Chmp3Q9CQ10 Gm22079-201ENSMUST00000157592 106 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Chmp3Q9CQ10 Gm24877-201ENSMUST00000158779 116 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Chmp3Q9CQ10 Snord53-201ENSMUST00000175146 78 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Chmp3Q9CQ10 Gm44966-201ENSMUST00000208096 157 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Chmp3Q9CQ10 Olfr1319-ps1-201ENSMUST00000208550 274 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Chmp3Q9CQ10 Tex16-201ENSMUST00000038546 3972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Chmp3Q9CQ10 Gm14946-201ENSMUST00000119859 296 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Chmp3Q9CQ10 Gm24650-201ENSMUST00000157105 103 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Chmp3Q9CQ10 Gm22212-201ENSMUST00000158096 106 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Chmp3Q9CQ10 Gm22535-201ENSMUST00000158174 119 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Chmp3Q9CQ10 Gm42960-201ENSMUST00000202160 241 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Chmp3Q9CQ10 Gm19118-201ENSMUST00000222554 98 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Chmp3Q9CQ10 AC126939.3-201ENSMUST00000226061 166 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Chmp3Q9CQ10 Gm26326-201ENSMUST00000083070 129 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Chmp3Q9CQ10 Stap1-206ENSMUST00000198435 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Chmp3Q9CQ10 AC153966.1-201ENSMUST00000220106 3764 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Chmp3Q9CQ10 Olfr726-204ENSMUST00000215105 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Chmp3Q9CQ10 Vmn1r76-202ENSMUST00000226300 8189 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Chmp3Q9CQ10 Gm22796-201ENSMUST00000157234 106 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Chmp3Q9CQ10 Gm24922-201ENSMUST00000158511 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Chmp3Q9CQ10 Gm24082-201ENSMUST00000175175 83 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Chmp3Q9CQ10 Mir6376-201ENSMUST00000185149 131 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Chmp3Q9CQ10 AC160962.3-201ENSMUST00000225914 112 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Chmp3Q9CQ10 AC115291.1-201ENSMUST00000226803 258 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Chmp3Q9CQ10 AC122828.3-201ENSMUST00000223019 3915 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Chmp3Q9CQ10 Mir682-201ENSMUST00000102281 96 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Chmp3Q9CQ10 Gm26339-201ENSMUST00000102368 99 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Chmp3Q9CQ10 Rhox11-ps3-201ENSMUST00000121166 233 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Chmp3Q9CQ10 Gm14671-201ENSMUST00000121790 262 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Chmp3Q9CQ10 Gm22500-201ENSMUST00000158982 99 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Chmp3Q9CQ10 Mir7013-201ENSMUST00000183540 72 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Chmp3Q9CQ10 AC127371.3-201ENSMUST00000228129 415 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Chmp3Q9CQ10 Mir34a-201ENSMUST00000083559 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Chmp3Q9CQ10 Snora33-201ENSMUST00000093556 129 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Chmp3Q9CQ10 Gm25091-201ENSMUST00000103997 71 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Chmp3Q9CQ10 Gm25878-201ENSMUST00000104327 93 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Chmp3Q9CQ10 Gm26099-201ENSMUST00000157248 109 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Chmp3Q9CQ10 Mir3092-201ENSMUST00000174954 96 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Chmp3Q9CQ10 AC174457.1-201ENSMUST00000215932 226 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Chmp3Q9CQ10 Gm22622-201ENSMUST00000082870 129 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Chmp3Q9CQ10 Olfr777-202ENSMUST00000204573 5407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Chmp3Q9CQ10 Mir547-201ENSMUST00000102051 78 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Chmp3Q9CQ10 Gm22674-201ENSMUST00000104413 131 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Chmp3Q9CQ10 Gm43439-201ENSMUST00000138710 322 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Chmp3Q9CQ10 Gm22338-201ENSMUST00000157715 129 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Chmp3Q9CQ10 Mir6405-201ENSMUST00000184584 124 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Chmp3Q9CQ10 Gm37807-201ENSMUST00000194310 190 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Chmp3Q9CQ10 CT033781.2-201ENSMUST00000221113 153 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Chmp3Q9CQ10 Gm25199-201ENSMUST00000083095 104 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Chmp3Q9CQ10 Gm26494-201ENSMUST00000083154 143 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Chmp3Q9CQ10 Mir301-201ENSMUST00000083655 86 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Chmp3Q9CQ10 Gm24493-201ENSMUST00000083805 143 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Chmp3Q9CQ10 Gm10234-201ENSMUST00000089304 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Chmp3Q9CQ10 Olfr1370-204ENSMUST00000215806 4322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Chmp3Q9CQ10 Hif1a-202ENSMUST00000110461 4385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Chmp3Q9CQ10 Olfr790-203ENSMUST00000215067 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Chmp3Q9CQ10 Gm22782-201ENSMUST00000104082 132 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Chmp3Q9CQ10 Gm24670-201ENSMUST00000104154 132 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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