Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Gm25742-201ENSMUST00000179530 79 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Chmp3Q9CQ10 Gm25209-201ENSMUST00000179576 79 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Chmp3Q9CQ10 Gm26392-201ENSMUST00000179661 79 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Chmp3Q9CQ10 Gm25230-201ENSMUST00000179740 79 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Chmp3Q9CQ10 Gm26434-201ENSMUST00000179778 79 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Chmp3Q9CQ10 Gm25741-201ENSMUST00000179825 79 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Chmp3Q9CQ10 Gm24759-201ENSMUST00000179827 79 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Chmp3Q9CQ10 Gm24219-201ENSMUST00000179861 79 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Chmp3Q9CQ10 Mir7242-201ENSMUST00000183710 79 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Chmp3Q9CQ10 Mir6917-201ENSMUST00000184111 61 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Chmp3Q9CQ10 Gm44464-201ENSMUST00000198010 138 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Chmp3Q9CQ10 Gm23254-201ENSMUST00000097244 79 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Chmp3Q9CQ10 Gm42675-201ENSMUST00000197552 4035 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Chmp3Q9CQ10 Vmn2r65-201ENSMUST00000044583 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Chmp3Q9CQ10 G2e3-203ENSMUST00000121521 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
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Chmp3Q9CQ10 Gm26247-201ENSMUST00000116702 91 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Chmp3Q9CQ10 Gm24718-201ENSMUST00000157521 136 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Chmp3Q9CQ10 Gm6788-201ENSMUST00000166459 270 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Chmp3Q9CQ10 Gm27379-201ENSMUST00000183730 123 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Chmp3Q9CQ10 Mir1195-201ENSMUST00000116818 98 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Chmp3Q9CQ10 Gm25153-201ENSMUST00000157118 156 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Chmp3Q9CQ10 Gm25711-201ENSMUST00000158633 128 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Chmp3Q9CQ10 Gm27786-201ENSMUST00000184337 70 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Chmp3Q9CQ10 Mir9-1-201ENSMUST00000199907 89 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Chmp3Q9CQ10 Gm44478-201ENSMUST00000204875 114 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Chmp3Q9CQ10 Mir369-201ENSMUST00000083627 79 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Chmp3Q9CQ10 Gpr174-201ENSMUST00000101294 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
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Chmp3Q9CQ10 Gm42718-201ENSMUST00000197319 2681 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Chmp3Q9CQ10 Gm2830-201ENSMUST00000140330 385 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Chmp3Q9CQ10 Gm15903-201ENSMUST00000155796 310 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
Chmp3Q9CQ10 Gm23253-201ENSMUST00000157441 104 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
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Chmp3Q9CQ10 B230216N24Rik-202ENSMUST00000159353 345 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
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Chmp3Q9CQ10 Mir3073b-201ENSMUST00000199383 60 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Chmp3Q9CQ10 Gm42807-201ENSMUST00000200141 329 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Chmp3Q9CQ10 AC129202.2-201ENSMUST00000225123 177 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
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Chmp3Q9CQ10 Vmn1r29-205ENSMUST00000228909 4658 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
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Chmp3Q9CQ10 Gm5141-202ENSMUST00000201047 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
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Chmp3Q9CQ10 Gm22731-201ENSMUST00000158086 94 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Chmp3Q9CQ10 Gm25371-201ENSMUST00000158162 101 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Chmp3Q9CQ10 Hmgb1l-201ENSMUST00000082150 571 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Chmp3Q9CQ10 AC124456.1-201ENSMUST00000217391 2597 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
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Chmp3Q9CQ10 Gm37027-201ENSMUST00000194642 256 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
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Chmp3Q9CQ10 Gm14709-201ENSMUST00000121225 304 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Chmp3Q9CQ10 Gm3848-201ENSMUST00000136693 299 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
Chmp3Q9CQ10 Gm24681-201ENSMUST00000158760 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Chmp3Q9CQ10 Gm20718-201ENSMUST00000176058 259 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Chmp3Q9CQ10 Mir7062-201ENSMUST00000185038 66 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Chmp3Q9CQ10 Gm28669-201ENSMUST00000188400 100 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Chmp3Q9CQ10 Snord118-201ENSMUST00000082965 135 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Chmp3Q9CQ10 Slain1os-201ENSMUST00000160117 3101 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
Chmp3Q9CQ10 Gm42785-201ENSMUST00000202316 3835 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Chmp3Q9CQ10 Gm24291-201ENSMUST00000157633 162 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Chmp3Q9CQ10 Gm25771-201ENSMUST00000158565 144 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Chmp3Q9CQ10 Gm9156-201ENSMUST00000189660 463 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Chmp3Q9CQ10 CAAA01090905.1-201ENSMUST00000219056 426 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Chmp3Q9CQ10 Gm22055-201ENSMUST00000083388 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Chmp3Q9CQ10 Olfr640-202ENSMUST00000218535 4009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Chmp3Q9CQ10 Slitrk6-201ENSMUST00000078386 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
Chmp3Q9CQ10 BC022960-201ENSMUST00000119987 1815 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Chmp3Q9CQ10 Olfr592-202ENSMUST00000106893 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
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