Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm23234-201ENSMUST00000157304 134 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Gm26148-201ENSMUST00000157430 68 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Gm23996-201ENSMUST00000158062 131 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Gm26213-201ENSMUST00000158582 110 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Gm22853-201ENSMUST00000174974 131 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Gm27392-201ENSMUST00000185041 101 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Chd9-201ENSMUST00000048665 12008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Vmn1r90-206ENSMUST00000227566 6901 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Cfap97-201ENSMUST00000034048 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Matr3-201ENSMUST00000166793 6262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 AC165080.4-201ENSMUST00000213591 9507 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Tnpo1-202ENSMUST00000109401 8453 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Kmt2d-201ENSMUST00000023741 19823 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Olfr681-204ENSMUST00000215564 4487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Gm23709-201ENSMUST00000104364 130 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Gm24509-201ENSMUST00000157086 101 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Gm25358-201ENSMUST00000157189 101 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Gm26036-201ENSMUST00000158149 144 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Gm8874-201ENSMUST00000196826 286 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Gm45533-201ENSMUST00000210295 165 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 AC141438.3-201ENSMUST00000215632 202 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 AC152062.1-201ENSMUST00000218129 386 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Mboat2-204ENSMUST00000221952 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Tyr-201ENSMUST00000004770 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Vmn1r9-202ENSMUST00000227399 6778 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Olfr145-202ENSMUST00000213688 6691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Olfr420-202ENSMUST00000213748 3806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Tbc1d32-201ENSMUST00000099739 7240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Vmn1r220-205ENSMUST00000228239 7849 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 CT009754.2-201ENSMUST00000221683 3661 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Gm884-201ENSMUST00000059279 10977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Gabrb1-201ENSMUST00000031122 13737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Uba6-201ENSMUST00000039373 6590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Malrd1-201ENSMUST00000146205 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Gm22593-201ENSMUST00000104245 109 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Gm24061-201ENSMUST00000157489 120 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Mir6516-201ENSMUST00000196236 110 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Gm44389-201ENSMUST00000203795 182 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 n-R5s152-201ENSMUST00000093641 119 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Olfr1271-202ENSMUST00000216383 6613 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Olfr535-207ENSMUST00000217235 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Ifi203-209ENSMUST00000156895 3605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Vmn1r196-204ENSMUST00000228382 6525 ntAPPRIS P2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Dnah1-201ENSMUST00000048603 12872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Slain1os-201ENSMUST00000160117 3101 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Fancd2-201ENSMUST00000036340 5512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Ccnb3-201ENSMUST00000056725 4475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Gm24377-201ENSMUST00000104398 131 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Gm14588-201ENSMUST00000119895 172 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Gm23960-201ENSMUST00000157206 131 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Gm24931-201ENSMUST00000158324 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Gm24681-201ENSMUST00000158760 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Gm16306-201ENSMUST00000160568 176 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Gm20391-201ENSMUST00000174722 106 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Gm24710-201ENSMUST00000175235 101 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Gm24797-201ENSMUST00000178103 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Gm24135-201ENSMUST00000179085 101 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Gm27878-201ENSMUST00000184000 106 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Gm6109-201ENSMUST00000223297 348 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Nlrp9a-204ENSMUST00000122040 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Olfr878-203ENSMUST00000214263 4003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Olfr933-202ENSMUST00000216238 4475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Olfr109-204ENSMUST00000217602 5437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Olfr1385-202ENSMUST00000214948 4412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Gm14569-204ENSMUST00000169499 5181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Homer2-202ENSMUST00000098326 10982 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Gm14039-201ENSMUST00000118705 101 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Gm44476-201ENSMUST00000196225 91 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Olfr1204-202ENSMUST00000213283 6935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Zfp113-201ENSMUST00000049393 6470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Ppig-202ENSMUST00000090858 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Cdh10-201ENSMUST00000040562 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Fam169a-202ENSMUST00000169863 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Gm22674-201ENSMUST00000104413 131 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Gm24508-201ENSMUST00000180104 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Gm24259-201ENSMUST00000083740 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Ankar-201ENSMUST00000053499 4571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Ralgapa2-202ENSMUST00000109986 11030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Gm15697-201ENSMUST00000121946 2902 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Lrrc4c-203ENSMUST00000162807 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Rev3l-207ENSMUST00000164763 10399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Fbxl17-204ENSMUST00000112840 3667 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Zfp735-201ENSMUST00000080407 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Olfr1270-203ENSMUST00000215578 4982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Gm13787-201ENSMUST00000120422 168 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Gm25908-201ENSMUST00000157624 98 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Gm26358-201ENSMUST00000158215 97 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Gm16539-201ENSMUST00000160086 327 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Gm17829-201ENSMUST00000219782 344 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Snora69-201ENSMUST00000083708 131 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Olfr548-ps1-202ENSMUST00000210064 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Hoxd11P23813 Gm23609-201ENSMUST00000104542 127 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Gm6954-201ENSMUST00000117416 225 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Gm25641-201ENSMUST00000175135 108 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Gm27580-201ENSMUST00000183666 149 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Zfp266-202ENSMUST00000174462 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Olfr699-203ENSMUST00000216307 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Cp-201ENSMUST00000003714 4092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Gm7298-201ENSMUST00000204124 4657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Lcorl-204ENSMUST00000087164 4979 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms