Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Gm22553-201ENSMUST00000157797 295 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rnf180Q3U827 Vmn2r-ps20-201ENSMUST00000179853 382 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rnf180Q3U827 Gm43199-201ENSMUST00000200019 307 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rnf180Q3U827 Mir7215-201ENSMUST00000200383 51 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rnf180Q3U827 Gm6105-201ENSMUST00000200580 624 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rnf180Q3U827 Gm23140-201ENSMUST00000082487 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rnf180Q3U827 Gm23264-201ENSMUST00000083372 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rnf180Q3U827 Gm7145-201ENSMUST00000185381 1794 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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Rnf180Q3U827 Olfr307-202ENSMUST00000213705 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rnf180Q3U827 Gm22051-201ENSMUST00000117002 127 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rnf180Q3U827 Gm11192-201ENSMUST00000127017 151 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rnf180Q3U827 Gm22221-201ENSMUST00000157362 103 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rnf180Q3U827 Gm24010-201ENSMUST00000157731 282 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rnf180Q3U827 Gm25599-201ENSMUST00000157816 103 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rnf180Q3U827 Gm26435-201ENSMUST00000179026 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rnf180Q3U827 Gm42807-201ENSMUST00000200141 329 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rnf180Q3U827 AC124182.1-201ENSMUST00000227091 321 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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Rnf180Q3U827 Gm24261-201ENSMUST00000083744 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rnf180Q3U827 Vmn1r76-203ENSMUST00000226947 8145 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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Rnf180Q3U827 Gm45518-201ENSMUST00000210776 2583 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rnf180Q3U827 Gm25170-201ENSMUST00000104191 129 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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Rnf180Q3U827 Gm26406-201ENSMUST00000158503 124 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rnf180Q3U827 Mir466b-1-201ENSMUST00000177988 82 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rnf180Q3U827 Vmn2r-ps17-201ENSMUST00000178733 375 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rnf180Q3U827 Gm6003-201ENSMUST00000187903 463 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rnf180Q3U827 Gm44938-201ENSMUST00000208614 427 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rnf180Q3U827 AC132384.11-201ENSMUST00000219676 178 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rnf180Q3U827 Olfr1370-204ENSMUST00000215806 4322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rnf180Q3U827 Pak3-202ENSMUST00000112863 8657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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Rnf180Q3U827 Gm23015-201ENSMUST00000104145 128 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rnf180Q3U827 Gm25985-201ENSMUST00000122677 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rnf180Q3U827 Gm24277-201ENSMUST00000158661 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rnf180Q3U827 Gm17364-201ENSMUST00000163881 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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Rnf180Q3U827 Vmn2r69-201ENSMUST00000171213 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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Rnf180Q3U827 Gm27047-201ENSMUST00000183072 1819 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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Rnf180Q3U827 Gm10730-201ENSMUST00000194097 2723 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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Rnf180Q3U827 Gm25381-201ENSMUST00000102078 109 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Rnf180Q3U827 Gm10959-201ENSMUST00000106431 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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Rnf180Q3U827 Olfr1228-203ENSMUST00000216392 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Rnf180Q3U827 Vmn1r29-204ENSMUST00000228038 4520 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
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Rnf180Q3U827 Gm16404-201ENSMUST00000177739 468 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Rnf180Q3U827 Gm24390-201ENSMUST00000179578 62 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Rnf180Q3U827 Gm14598-201ENSMUST00000180109 468 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Rnf180Q3U827 Gm14625-201ENSMUST00000180231 468 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Rnf180Q3U827 Gm43749-201ENSMUST00000199345 352 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Rnf180Q3U827 Gm45386-201ENSMUST00000210194 218 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Rnf180Q3U827 Gm45791-201ENSMUST00000212908 352 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Rnf180Q3U827 AC132221.1-201ENSMUST00000220577 3841 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Rnf180Q3U827 Gm6109-201ENSMUST00000223297 348 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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