Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 BABAM2-201ENST00000342045 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 RBM11-201ENST00000400577 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 RACGAP1-221ENST00000551016 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC007923.2-201ENST00000584218 1591 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 NOX1-202ENST00000372960 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 LAMB4-201ENST00000205386 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 ENPP5-202ENST00000371383 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 NHEJ1-202ENST00000409720 1954 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 UTY-212ENST00000545955 6817 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 ABI1-202ENST00000359188 3492 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 ZNF677-206ENST00000598513 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 CCR2-204ENST00000445132 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 NEMP2-202ENST00000409150 6168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 LINC00184-201ENST00000429269 2270 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 GNG3-201ENST00000294117 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 OR7D4-201ENST00000308682 1022 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 OR51L1-201ENST00000321543 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 OR2G6-201ENST00000343414 1049 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
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FOXE3Q13461 AC090114.1-201ENST00000393266 448 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
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FOXE3Q13461 MEG8-201ENST00000414488 800 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 LINC00266-1-202ENST00000425473 629 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
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FOXE3Q13461 HOTTIP_2.1-201ENST00000616633 376 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
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FOXE3Q13461 AL031651.1-201ENST00000615357 1438 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 SAMMSON-222ENST00000641901 2727 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 LINC01994-201ENST00000496220 1808 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 ANKRD31-201ENST00000274361 6036 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 CD86-209ENST00000493101 1572 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AHI1-204ENST00000367800 5921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC091544.5-201ENST00000620192 3815 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 FBXW10-202ENST00000308799 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 SERPINA11-201ENST00000334708 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 GOLGB1-201ENST00000340645 11187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 FYB1-210ENST00000515010 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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