Protein–RNA interactions for Protein: D3YXG0

Hmcn1, Hemicentin-1, mousemouse

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Length 5,634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmcn1D3YXG0 Olfr1459-202ENSMUST00000213493 8854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Gm23010-201ENSMUST00000104151 126 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Mir295-201ENSMUST00000104694 69 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Hmgb1-rs18-201ENSMUST00000117940 627 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Gm22770-201ENSMUST00000158368 67 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Gm26171-201ENSMUST00000158422 131 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Mir5123-201ENSMUST00000177794 83 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Gm8874-201ENSMUST00000196826 286 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Igkv2-105-201ENSMUST00000196931 377 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Gm43193-201ENSMUST00000197732 441 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 CT486006.1-201ENSMUST00000216797 227 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 AC122924.1-201ENSMUST00000222044 163 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Gm26062-201ENSMUST00000083379 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Neb-203ENSMUST00000075301 21456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Rpl30-ps1-201ENSMUST00000119767 348 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Gm14748-201ENSMUST00000119819 411 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Tra2b-ps-201ENSMUST00000119906 168 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Gm12721-201ENSMUST00000120621 268 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Gm26487-201ENSMUST00000158022 94 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Gm23543-201ENSMUST00000158207 106 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Gm20619-204ENSMUST00000181343 786 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Gm30341-201ENSMUST00000194363 289 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Gm44336-201ENSMUST00000203696 468 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Gm44521-201ENSMUST00000206469 217 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Gm45070-201ENSMUST00000208100 246 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Gm5176-202ENSMUST00000220267 583 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Gm22302-201ENSMUST00000082657 106 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Tet1-206ENSMUST00000174189 14369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Mir758-201ENSMUST00000103260 81 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Gm25621-201ENSMUST00000157223 114 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Gm23599-201ENSMUST00000157261 251 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Gm25491-201ENSMUST00000158733 308 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Gm26359-201ENSMUST00000158873 101 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Gm29093-201ENSMUST00000187366 409 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 CT572985.2-201ENSMUST00000220496 211 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Gm35190-201ENSMUST00000222335 526 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 AC151907.1-201ENSMUST00000228812 412 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Gm23451-201ENSMUST00000083328 122 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Snord57-201ENSMUST00000083338 72 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Vmn1r46-206ENSMUST00000228401 10955 ntAPPRIS P1 BASIC0.95□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Trps1-202ENSMUST00000165201 9859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Fryl-201ENSMUST00000094700 9852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Ros1-201ENSMUST00000020045 7401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Traj24-201ENSMUST00000103717 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.95□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Gm23911-201ENSMUST00000104596 134 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Gm13457-201ENSMUST00000117885 267 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Gm13314-201ENSMUST00000118742 335 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Defa-ps6-201ENSMUST00000122172 282 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Gm25882-201ENSMUST00000157784 85 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Gm8207-201ENSMUST00000171204 502 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 AC134596.2-201ENSMUST00000222158 171 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Gm25134-201ENSMUST00000082646 160 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Gm10343-201ENSMUST00000096279 348 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Prrc2c-210ENSMUST00000182660 11502 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
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Hmcn1D3YXG0 Gm8880-201ENSMUST00000121800 454 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
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Hmcn1D3YXG0 Ep400-201ENSMUST00000041558 10608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 4932415D10Rik-202ENSMUST00000217661 15111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Gm25274-201ENSMUST00000104296 135 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
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Hmcn1D3YXG0 Gm12053-201ENSMUST00000119022 252 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Gm25470-201ENSMUST00000175576 111 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 CT010480.5-201ENSMUST00000225026 217 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Gm4070-202ENSMUST00000176467 9007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Mir493-201ENSMUST00000103837 83 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Gm22935-201ENSMUST00000103960 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Gm11065-201ENSMUST00000111462 228 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Gm15526-201ENSMUST00000112504 204 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Hmgb1-ps4-201ENSMUST00000118281 635 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Gm24892-201ENSMUST00000122747 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Gm22963-201ENSMUST00000157960 91 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Gm23824-201ENSMUST00000158741 276 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Rpl30-ps6-201ENSMUST00000163337 348 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Gm29047-201ENSMUST00000189816 108 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Gm9379-201ENSMUST00000196790 646 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Gm42506-201ENSMUST00000202009 150 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Gm44765-201ENSMUST00000206927 601 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Gm44870-201ENSMUST00000207291 357 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 Gm45366-201ENSMUST00000209828 384 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Hmcn1D3YXG0 AC122924.2-201ENSMUST00000220799 298 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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