Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 BTG1P1-201ENST00000540396 508 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC023905.1-201ENST00000559799 1178 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AJ009632.2-205ENST00000635225 1169 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 TMEM31-201ENST00000319560 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP77-201ENST00000363261 353 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AL355581.1-201ENST00000415964 830 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AP003033.2-201ENST00000528901 805 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 LINC01477-201ENST00000566101 1226 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC084782.1-201ENST00000564401 2465 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 RBBP4P5-201ENST00000398583 1266 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 AC093535.1-203ENST00000512500 730 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 ASPH-226ENST00000522919 1277 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 LYRM1-208ENST00000567954 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TM6SF1Q9BZW5 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151 ms